Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE4DQ08499 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms