Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4BQ07343 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms