Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RNASELQ05823 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms