Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNC4Q03721 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms