Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DSG1Q02413 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms