Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SPIBQ01892 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms