Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SPTBN1Q01082 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPTBN1Q01082 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms