Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF9Q00978 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF9Q00978 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms