Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SIM1P81133 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIM1P81133 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIM1P81133 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms