Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2IP78347 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2IP78347 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms