Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVK-16P61578 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms