Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5BP61020 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB5BP61020 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms