Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBASH3AP57075 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBASH3AP57075 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms