Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASP6P55212 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CASP6P55212 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASP6P55212 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASP6P55212 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms