Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ELLP55199 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELLP55199 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELLP55199 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELLP55199 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms