Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MANFP55145 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MANFP55145 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MANFP55145 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MANFP55145 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MANFP55145 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MANFP55145 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MANFP55145 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MANFP55145 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MANFP55145 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MANFP55145 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms