Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ARFIP1P53367 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP1P53367 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms