Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPIAP49247 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RPIAP49247 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RPIAP49247 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RPIAP49247 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPIAP49247 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms