Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GATA4P43694 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GATA4P43694 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
GATA4P43694 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GATA4P43694 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATA4P43694 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATA4P43694 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms