Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CEACAM3P40198 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEACAM3P40198 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms