Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHI3L1P36222 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms