Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NTF4P34130 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF4P34130 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms