Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ABCD1P33897 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms