Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCR7P32248 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCR7P32248 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCR7P32248 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms