Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRS3P32247 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRS3P32247 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRS3P32247 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms