Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRA5P31644 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABRA5P31644 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms