Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATP5DP30049 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms