Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MARCKSP29966 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MARCKSP29966 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MARCKSP29966 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MARCKSP29966 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms