Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4AP27815 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4AP27815 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms