Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHMLP26374 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHMLP26374 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHMLP26374 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHMLP26374 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHMLP26374 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms