Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTX3P26022 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTX3P26022 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTX3P26022 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms