Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ITGA3P26006 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms