Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NFKBIAP25963 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms