Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PSMA3P25788 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PSMA3P25788 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms