Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPRGP23470 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPRGP23470 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
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