Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HOXA5P20719 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms