Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATF3P18847 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATF3P18847 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATF3P18847 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATF3P18847 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATF3P18847 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATF3P18847 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATF3P18847 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATF3P18847 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms