Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCC1P18754 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCC1P18754 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RCC1P18754 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RCC1P18754 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms