Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPI1P17947 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms