Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN2P17655 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms