Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTRB1P17538 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms