Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL3P10147 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL3P10147 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCL3P10147 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCL3P10147 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms