Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
IL3P08700 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IL3P08700 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IL3P08700 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IL3P08700 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IL3P08700 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IL3P08700 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IL3P08700 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms