Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRCP08575 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRCP08575 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
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