Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNA21P01568 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms