Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KDM4AO75164 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms