Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms