Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CXCL13O43927 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms