Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OIP5O43482 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OIP5O43482 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OIP5O43482 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OIP5O43482 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OIP5O43482 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms