Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEFVO15553 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MEFVO15553 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEFVO15553 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEFVO15553 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEFVO15553 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEFVO15553 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEFVO15553 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEFVO15553 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEFVO15553 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms